Immunité
et Vaccination

Chef(fe) d'équipe :

Combadière Behazine

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L’efficacité vaccinale est un enjeu majeur de santé publique pour la protection contre les maladies infectieuses. La vaccinologie est un domaine multidisciplinaire qui progresse aujourd’hui vers la découverte de biomarqueurs précoces de l’efficacité vaccinale afin d’accélérer le développement des vaccins. Les réponses humorales sont considérées comme des marqueurs d’efficacité des réponses immunitaires pour la protection mais ces réponses sont détectées des mois après la vaccination. Les réponses aux vaccins sont hétérogènes et variables suivant les individus. Cette hétérogénéité est due à plusieurs facteurs : 1) les facteurs génétiques, 2) les facteurs liés à l’individu (histoire immunologique, microbiote, obésité, age, maladies chroniques, allergies etc..) et 3) la stratégie vaccinale (formulation, nombre de doses, site d’injection etc..). Nous étudions l’impact de ces deux derniers facteurs sur les réponses vaccinales.

La recherche de biomarqueurs précoces (heures/jours suivant la vaccination) est un enjeu clé pour prédire le degré d’efficacité du vaccin qui 1) permettra d’affiner rapidement les stratégies de vaccination ; 2) aider à sélectionner à des phases précoces plusieurs candidats vaccins et, enfin 3) progresser dans la compréhension des voies biologiques complexes impliquées dans l’initiation de l’immunité adaptative.

Nous avons récemment démontré l’impact majeur de la signature d’expression des gènes dans le sang avant ou 1 jour après l’administration d’un vaccin sur la qualité de l’immunité adaptative (cellules humorales versus cellules cytotoxiques CD8). Nous avons pour objectifs d’utiliser les données biologiques générées lors des études cliniques de plusieurs vaccins afin de proposer des hypothèses mécanistiques et d’identifier des biomarqueurs candidats de l’efficacité immunologique des vaccins.

Mots Clés : Mécanisme immunitaire – Transcriptome – Immunité adaptative – Biomarqueurs – Cytométrie multiparamétrique (Spectral, cytof) – Immunité innée

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Les membres de l'équipe

COMBADIERE Béhazine

COMBADIERE Béhazine

DR Inserm, Team Leader

PUBLONS
BOCCARA David

BOCCARA David

PU_PH

SORIA Angèle

SORIA Angèle

PU_PH

BONDUELLE Olivia

BONDUELLE Olivia

Engineer - IE- SU

BENNACER Selma

BENNACER Selma

Engineer - IE

WOKAM Michèle-Noel

WOKAM Michèle-Noel

Engineer - IE

THIAM Saliou

THIAM Saliou

IE bio-informatique

Nos recherches se déclinent en 2 axes

1. Générer et consolider les données biologiques après vaccination

L’objectif est d’étudier les réseaux immunitaires moléculaires et cellulaires dans le sang après vaccination (vaccins ciblant le VIH, la Covid19, la grippe saisonnière) et déterminer leur rôle dans l’induction des réponses adaptatives en utilisant des approches de biologie des systèmes dans des essais cliniques chez l’homme. Le programme repose sur une collection unique de données qui conduiront à la découverte de biomarqueurs ainsi que sur des approches méthodologiques basées sur plusieurs études cliniques (2016-2022) en collaboration avec des partenaires nationaux et européens (projet H2020, FRM, Eurostars, BPI France).

2. 2. Interpréter la signature immunitaire innée précoce en découverte des mécanismes de la réponse immunitaire induite par le vaccin.

L’objectif est d’accroître nos connaissances de base sur l’immunité innée, ce qui pourrait prédire les réponses immunitaires attendues chez la plupart des individus après la vaccination. Nous visons à trouver des biomarqueurs cellulaires et moléculaires (données recueillies dans l’axe 1) qui dictent les résultats biologiques liés à la protection contre les infections. Nous utilisons des modèles précliniques afin d’étudier les mécanismes immunitaires initiaux reliant l’immunité précoce à une protection à long terme contre l’infection.

Les opportunités

  • Mécanisme immunitaire (Covid19, grippe, VIH, virus de la vaccine, vaccin à base d’adjuvant, nanoparticules)
  • Vaccinologie des systèmes
  • Biomarqueurs de l’efficacité vaccinale
  • Etudes cliniques phase I/II
  • Modèles murins

Les publications

1.

A comparison of Sars-Cov-2 vaccine platforms: the CoviCompare project. Molino D, Durier C, Radenne A, Desaint C, Ropers J, Courcier S, Vieillard LV, Rekacewicz C, Parfait B, Appay V, Batteux F, Barillot E, Cogné M, Combadière B, Eberhardt CS, Gorochov G, Hupé P, Ninove L, Paul S, Pellegrin I, van der Werf S, Lefebvre M, Botelho-Nevers E, Ortega-Perez I, Jaspard M, Sow S, Lelièvre JD, de Lamballerie X, Kieny MP, Tartour E, Launay O. Nat Med. 2022 May;28(5):882-884. doi: 10.1038/s41591-022-01785-4.PMID: 35513532 No abstract available.

2.

Dichotomy in Neutralizing Antibody Induction to Peptide-Conjugated Vaccine in Squalene Emulsion Contrast With Aluminum Hydroxide Formulation. Bonduelle O, Chaudesaigues C, Tolazzi M, Suleiman E, de Bernard S, Alves K, Nourikyan J, Bohec M, Baudrin LG, Katinger D, Debré P, Scarlatti G, Vieillard V, Combadière B. Front Immunol. 2022 Apr 7;13:848571. doi: 10.3389/fimmu.2022.848571. eCollection 2022.PMID: 35464449 Free PMC article.

3.

Epigenetic landscape in the kick-and-kill therapeutic vaccine BCN02 clinical trial is associated with antiretroviral treatment interruption (ATI) outcome.  Oriol-Tordera B, Esteve-Codina A, Berdasco M, Rosás-Umbert M, Gonçalves E, Duran-Castells C, Català-Moll F, Llano A, Cedeño S, Puertas MC, Tolstrup M, Søgaard OS, Clotet B, Martínez-Picado J, Hanke T, Combadiere B, Paredes R, Hartigan-O’Connor D, Esteller M, Meulbroek M, Calle ML, Sanchez-Pla A, Moltó J, Mothe B, Brander C, Ruiz-Riol M. EBioMedicine. 2022 Apr;78:103956. doi: 10.1016/j.ebiom.2022.103956. Epub 2022 Mar 21.PMID: 35325780 Free PMC article.

4.

Letter to the editor: Increase of influenza vaccination coverage rates during the COVID-19 pandemic and implications for the upcoming influenza season in northern hemisphere countries and Australia.  Del Riccio M, Lina B, Caini S, Staadegaard L, Wiegersma S, Kynčl J, Combadière B, MacIntyre CR, Paget J. Euro Surveill. 2021 Dec;26(50):2101143. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.50.2101143.PMID: 34915972 Free PMC article. No abstract available.

5.

LOX-1-Expressing Immature Neutrophils Identify Critically-Ill COVID-19 Patients at Risk of Thrombotic Complications. Combadière B, Adam L, Guillou N, Quentric P, Rosenbaum P, Dorgham K, Bonduelle O, Parizot C, Sauce D, Mayaux J, Luyt CE, Boissonnas A, Amoura Z, Pourcher V, Miyara M, Gorochov G, Guihot A, Combadière C. Front Immunol. 2021 Sep 20;12:752612. doi: 10.3389/fimmu.2021.752612. eCollection 2021. PMID: 34616409 Free PMC article.

6.

CD8+PD-L1+CXCR3+ polyfunctional T cell abundances are associated with survival in critical SARS-CoV-2-infected patients. Adam L, Rosenbaum P, Quentric P, Parizot C, Bonduelle O, Guillou N, Corneau A, Dorgham K, Miyara M, Luyt CE, Guihot A, Gorochov G, Combadière C, Combadière B. JCI Insight. 2021 Sep 22;6(18):e151571. doi: 10.1172/jci.insight.151571. PMID: 34283810

7.

OVX836 Heptameric Nucleoprotein Vaccine Generates Lung Tissue-Resident Memory CD8+ T-Cells for Cross-Protection Against Influenza. Del Campo J, Bouley J, Chevandier M, Rousset C, Haller M, Indalecio A, Guyon-Gellin D, Le Vert A, Hill F, Djebali S, Leverrier Y, Marvel J, Combadière B, Nicolas F. Front Immunol. 2021 Jun 10;12:678483. doi: 10.3389/fimmu.2021.678483. eCollection 2021. PMID: 34177921

8.

Host Transcriptome and Microbiota Signatures Prior to Immunization Profile Vaccine Humoral Responsiveness. Gonçalves E, Guillén Y, Lama JR, Sanchez J, Brander C, Paredes R, Combadière B. Front Immunol. 2021 May 10;12:657162. doi: 10.3389/fimmu.2021.657162. eCollection 2021. PMID: 34040607 Free PMC article.

9.

Immune Profiles Identification by Vaccinomics After MVA Immunization in Randomized Clinical Study. Sanchez J, Gonçalves E, Llano A, Gonzáles P, Fernández-Maldonado M, Vogt A, Soria A, Perez S, Cedeño S, Fernández MA, Nourikyan J, de Bernard S, Ganoza C, Pedruzzi E, Bonduelle O, Mothe B, Gòmez CE, Esteban M, Garcia F, Lama JR, Brander C, Combadiere B. Front Immunol. 2020 Nov 10;11:586124. doi: 10.3389/fimmu.2020.586124. eCollection 2020. PMID: 33244316

10.

Mechanisms of innate events during skin reaction following intradermal injection of seasonal influenza vaccine. Gonnet J, Poncelet L, Meriaux C, Gonçalves E, Weiss L, Tchitchek N, Pedruzzi E, Soria A, Boccara D, Vogt A, Bonduelle O, Hamm G, Ait-Belkacem R, Stauber J, Fournier I, Wisztorski M, Combadiere B. J Proteomics. 2020 Mar 30;216:103670. doi: 10.1016/j.jprot.2020.103670. Epub 2020 Jan 25. PMID: 31991189

11.

[Towards the discovery of an early molecular signature to predict the response to influenza vaccination]. Gonçalves E, Combadière B. Med Sci (Paris). 2020 Jan;36(1):31-37. doi: 10.1051/medsci/2019266. Epub 2020 Feb 4. PMID: 32014095

12.

HIV therapeutic vaccine enhances non-exhausted CD4+ T cells in a randomised phase 2 trial. Vieillard V, Combadière B, Tubiana R, Launay O, Pialoux G, Cotte L, Girard PM, Simon A, Dudoit Y, Reynes J, Rockstroh J, Garcia F, Gatell J, Devidas A, Yazdanpanah Y, Weiss L, Fätkenheuer G, Autran B, Joyeux D, Gharakhanian S, Debré P, Katlama C. NPJ Vaccines. 2019 Jun 3;4:25. doi: 10.1038/s41541-019-0117-5. eCollection 2019. PMID: 31231551