Immunité
et Vaccination

Chef(fe) d'équipe :

Combadière Behazine

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L’efficacité vaccinale est un enjeu majeur de santé publique pour la protection contre les maladies infectieuses. La vaccinologie est un domaine multidisciplinaire qui progresse aujourd’hui vers la découverte de biomarqueurs précoces de l’efficacité vaccinale afin d’accélérer le développement des vaccins. Les réponses humorales sont considérées comme des marqueurs d’efficacité des réponses immunitaires pour la protection mais ces réponses sont détectées des mois après la vaccination. Les réponses aux vaccins sont hétérogènes et variables suivant les individus. Cette hétérogénéité est due à plusieurs facteurs : 1) les facteurs génétiques, 2) les facteurs liés à l’individu (histoire immunologique, microbiote, obésité, age, maladies chroniques, allergies etc..) et 3) la stratégie vaccinale (formulation, nombre de doses, site d’injection etc..). Nous étudions l’impact de ces deux derniers facteurs sur les réponses vaccinales.

La recherche de biomarqueurs précoces (heures/jours suivant la vaccination) est un enjeu clé pour prédire le degré d’efficacité du vaccin qui 1) permettra d’affiner rapidement les stratégies de vaccination ; 2) aider à sélectionner à des phases précoces plusieurs candidats vaccins et, enfin 3) progresser dans la compréhension des voies biologiques complexes impliquées dans l’initiation de l’immunité adaptative.

Nous avons récemment démontré l’impact majeur de la signature d’expression des gènes dans le sang avant ou 1 jour après l’administration d’un vaccin sur la qualité de l’immunité adaptative (cellules humorales versus cellules cytotoxiques CD8). Nous avons pour objectifs d’utiliser les données biologiques générées lors des études cliniques de plusieurs vaccins afin de proposer des hypothèses mécanistiques et d’identifier des biomarqueurs candidats de l’efficacité immunologique des vaccins.

Mots Clés : Mécanisme immunitaire – Transcriptome – Immunité adaptative – Biomarqueurs – Cytométrie multiparamétrique (Spectral, cytof) – Immunité innée

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Les membres de l'équipe

COMBADIERE Béhazine

COMBADIERE Béhazine

DR Inserm, Team Leader

PUBLONS
BOCCARA David

BOCCARA David

PU_PH

SORIA Angèle

SORIA Angèle

PU_PH

BONDUELLE Olivia

BONDUELLE Olivia

Engineer - IE- SU

BENNACER Selma

BENNACER Selma

Engineer - IE

WOKAM Michèle-Noel

WOKAM Michèle-Noel

Engineer - IE

THIAM Saliou

THIAM Saliou

IE bio-informatique

Nos recherches se déclinent en 2 axes

1. Générer et consolider les données biologiques après vaccination

L’objectif est d’étudier les réseaux immunitaires moléculaires et cellulaires dans le sang après vaccination (vaccins ciblant le VIH, la Covid19, la grippe saisonnière) et déterminer leur rôle dans l’induction des réponses adaptatives en utilisant des approches de biologie des systèmes dans des essais cliniques chez l’homme. Le programme repose sur une collection unique de données qui conduiront à la découverte de biomarqueurs ainsi que sur des approches méthodologiques basées sur plusieurs études cliniques (2016-2022) en collaboration avec des partenaires nationaux et européens (projet H2020, FRM, Eurostars, BPI France).

2. 2. Interpréter la signature immunitaire innée précoce en découverte des mécanismes de la réponse immunitaire induite par le vaccin.

L’objectif est d’accroître nos connaissances de base sur l’immunité innée, ce qui pourrait prédire les réponses immunitaires attendues chez la plupart des individus après la vaccination. Nous visons à trouver des biomarqueurs cellulaires et moléculaires (données recueillies dans l’axe 1) qui dictent les résultats biologiques liés à la protection contre les infections. Nous utilisons des modèles précliniques afin d’étudier les mécanismes immunitaires initiaux reliant l’immunité précoce à une protection à long terme contre l’infection.

Les opportunités

  • Mécanisme immunitaire (Covid19, grippe, VIH, virus de la vaccine, vaccin à base d’adjuvant, nanoparticules)
  • Vaccinologie des systèmes
  • Biomarqueurs de l’efficacité vaccinale
  • Etudes cliniques phase I/II
  • Modèles murins

Les publications

1.

Combadière B, Adam L, Guillou N, Quentric P, Rosenbaum P, Dorgham K, Bonduelle O, Parizot C, Sauce D, Mayaux J, Luyt CE, Boissonnas A, Amoura Z, Pourcher V, Miyara M, Gorochov G, Guihot A, Combadière C. LOX-1-Expressing Immature Neutrophils Identify Critically-Ill COVID-19 Patients at Risk of Thrombotic Complications. Front Immunol. 2021 Sep, 20;12:752612. doi: 10.3389/fimmu.2021.752612

2.

Adam L, Rosenbaum P, Quentric P, Parizot C, Bonduelle O, Guillou N, CorneauA, Dorgham K, Miyara M, Luyt CE, Guihot A, Gorochov G, Combadière C, Combadière B. CD8+PD-L1+CXCR3+ polyfunctional T cell abundances are associated with survival in critical SARS-CoV-2-infected patients. JCI Insight. 2021 Sep , 22;6(18):e151571. doi: 10.1172/jci.insight.151571

3.

Del Campo J, Bouley J, Chevandier M, Rousset C, Haller M, Indalecio A, Guyon-Gellin D, Le Vert A, Hill F, Djebali S, Leverrier Y, Marvel J, Combadière B, Nicolas F. OVX836 Heptameric Nucleoprotein Vaccine Generates Lung Tissue-Resident Memory CD8+ T-Cells for Cross-Protection Against Influenza. Front Immunol. 2021 Jun, 10;12:678483. doi: 10.3389/fimmu.2021.678483

4.

Gonçalves E, Guillén Y, Lama JR, Sanchez J, Brander C, Paredes R, Combadière B. Host Transcriptome and Microbiota Signatures Prior to Immunization Profile Vaccine Humoral Responsiveness. Front Immunol. 2021 May, 10;12:657162. doi: 10.3389/fimmu.2021.657162

5.

Sanchez J, Goncalves E, Llano A, Gonzales P, Fernandez-Maldonado M, Vogt A, Soria A, Perez S, Cedeno S, Fernandez MA, Nourikyan J, de Bernard S, Ganoza C, Pedruzzi E, Bonduelle O, Mothe B, Gomez CE, Esteban M, Garcia F, Lama JR, Brander C, Combadiere B. Immune Profiles Identification by Vaccinomics After MVA Immunization in Randomized Clinical Study. Front Immunol. 2020 Nov, 10;11:586124. doi: 10.3389/fimmu.2020.586124

6.

Gonnet J, Poncelet L, Meriaux C, Gonçalves E, Weiss L, Tchitchek N, Pedruzzi E, Soria A, Boccara D, Vogt A, Bonduelle O, Hamm G, Ait-Belkacem R, Stauber J, Fournier I, Wisztorski M, Combadiere B. Mechanisms of innate events during skin reaction following intradermal injection of seasonal influenza vaccine. J Proteomics. 2020 Mar, 30;216:103670. doi: 10.1016/j.jprot.2020.103670

7.

Goncalves E, Combadiere B. Towards the discovery of an early molecular signature to predict the response to influenza vaccination. Med Sci (Paris). 2020, Jan;36(1):31-37. doi: 10.1051/medsci/2019266

8.

Vieillard V, Combadière B, Tubiana R, Launay O, Pialoux G, Cotte L, Girard PM, Simon A, Dudoit Y, Reynes J, Rockstroh J, Garcia F, Gatell J, Devidas A, Yazdanpanah Y, Weiss L, Fätkenheuer G, Autran B, Joyeux D, Gharakhanian S, Debré P, Katlama C. HIV therapeutic vaccine enhances non-exhausted CD4+ T cells in a randomised phase 2 trial. NPJ Vaccines. 2019 Jun, 3;4:25. doi: 10.1038/s41541-019-0117-5

9.

Gonçalves, E.; Bonduelle, O.; Soria, A.; Loulergue, P.; Rousseau, A.; Cachanado, M.; Bonnabau, H.; Thiebaut, R.; Tchitchek, N.; Behillil, S.; et al. Innate gene signature distinguishes humoral versus cytotoxic responses to influenza vaccination. Journal of Clinical Investigation 2019 Mar, 129, 1960–1971, doi:10.1172/JCI125372

10.

Bonduelle, O.; Carrat, F.; Luyt, C.-E.; Leport, C.; Mosnier, A.; Benhabiles, N.; Krivine, A.; Rozenberg, F.; Yahia, N.; Samri, A.; et al. Characterization of pandemic influenza immune memory signature after vaccination or infection. Journal of Clinical Investigation 2014 Jul, 124, 3129–3136, doi:10.1172/JCI74565

11.

Duffy D, Perrin H, Abadie V, Benhabiles N, Boissonnas A, Liard C, Descours B, Reboulleau D, Bonduelle O, Verrier B, Van Rooijen N, Combadiere C, Combadiere B.
Neutrophils transport antigen from the dermis to the bone marrow, initiating a source of memory CD8+ T cells. Immunity. 2012 Nov , 37(5):917-29. doi: 10.1016/j.immuni.2012.07.015

12.

Puissant-Lubrano B, Bossi P, Gay F, Crance JM, Bonduelle O, Garin D, Bricaire F, Autran B, Combadiere B. Control of vaccinia virus skin lesions by long-term-maintained IFN-gamma+TNF-alpha+ effector/memory CD4+ lymphocytes in humans. J Clin Invest. 2010 May, 120(5):1636-44. doi: 10.1172/JCI38506

13.

Vogt A, Mahe B, Costagliola D, Bonduelle O, Hadam S, Schaefer G, Schaefer H, Katlama C, Sterry W, Autran B, Blume-Peytavi U, Combadiere B. Transcutaneous anti-influenza vaccination promotes both CD4 and CD8 T cell immune responses in humans. J Immunol. 2008 Feb, 180(3):1482-9. doi: 10.4049/jimmunol.180.3.1482

14.

Vogt A, Combadiere B, Hadam S, Stieler KM, Lademann J, Schaefer H, Autran B, Sterry W, Blume-Peytavi U. 40 nm, but not 750 or 1,500 nm, nanoparticles enter epidermal CD1a+ cells after transcutaneous application on human skin. J Invest Dermatol. 2006 Jun, 126(6):1316-22. doi: 10.1038/sj.jid.5700226