Équipe FRM 2022 – G Gorochov 10 janvier 2023

Des recherches récentes suggèrent une synergie équilibrée entre le système immunitaire de l’hôte et le microbiome. La dysbiose du microbiome intestinal pourrait altérer cette synergie et aggraver la gravité de la maladie dans les déficits primaires en anticorps (PAD). Notre objectif est de démêler les signatures microbiennes et immunitaires qui séparent les phénotypes cliniques et d’élucider l’impact d’un supplément d’anticorps sur l’issue des maladies associées au PAD. Nous atteindrons cet objectif en i) décryptant la contribution du virome à l’écologie microbienne intestinale, ii) en élucidant la dynamique du microbiome et des profils immunitaires, iii) en caractérisant l’effet du supplément d’anticorps dans un modèle de souris PAD et iv) en développant des modèles prédictifs d’évolution de la maladie. Nous utiliserons la puissance de la métagénomique profonde pour fournir une perspective complète du bactériome, de l’archéome, du mycobiome et du virome dans la cohorte PAD. Le rôle causal du microbiome dans la médiation des phénotypes cliniques associés à la PAD sera exploré par greffe de microbiome dans un modèle murin de PAD. En couplant l’échantillonnage clinique, le microbiome et le profilage immunitaire avec des modèles animaux et l’apprentissage automatique, nous construirons un modèle prédictif de la progression de la maladie. Nous évaluerons la thérapie de supplémentation orale par IgA dans le modèle murin, dans le but de contrôler la dysbiose associée au déficit en IgA. Ce travail fournira une vue intégrée de la composition du microbiome dans le PAD à haut risque qui pourrait fournir des biomarqueurs tant attendus de risque de compications hépatiques sévères. De plus, nous fournirons une preuve de concept de la possibilité de manipulation ciblée du microbiome basée sur une supplémentation en anticorps, potentiellement pertinente pour le traitement non seulement des PAD, mais des conditions impliquant des dérégulations du microbiome-immunitaire.